Аниме продолжает рассказ о старых долгах и новых вызовах, с которыми сталкиваются персонажи Деревни Листвы. Неведомый враг предъявляет Конохе кровавый счет, и лишь на Наруто, его друзей, учителей и старших товарищей ложится ответственность за спасение Страны Огня.

Наруто, Сакура, Хината, целитель Синно и его ученица Амару отправляются на помощь приграничной деревни, где их ждут враги, битвы, крушение надежд и боль предательства. В этом продолжении аниме раскрываются неразрывные узы между земляками, друзьями, учителями и учениками, выдержавшие время, расстояния, непонимание и гордыню. "Наруто 5" - это история о верности, дружбе и выборе, которая продолжит захватывающий рассказ о жизни и приключениях в мире Наруто.